贞元年间，因掌管人、妖两界的白泽神女意外身亡，白泽令不知所踪，妖兽在人间肆意流窜，作恶多端，且发生越来越多血腥凶案。此时已化为人形的百妖之首“朱厌化名赵远舟，主动“投诚”，提出协助朝廷组建缉妖司，缉妖

1945年抗战胜利前夕，侵华日军第七三一部队在哈尔滨平房区以“给水防疫”为名，秘密进行惨无人道的细菌战研究，大肆抓捕平民进行活体实验，妄图以此扭转败局。小贩王永章（姜武 饰）等人被强行抓入“特设监狱”